El gobierno, representación y administración de la Fundación Universitario de Ferrol  está encomendado a un Patronato que ejecutará las funciones que le corresponden,  con sujeción a lo dispuesto en el Ordenamiento Jurídico y en sus Estatutos y que constará de un mínimo de cuatro miembros y un máximo de nueve.

El primer Patronato, designado en el Acta Fundacional, estuvo formado por siete  miembros, el mismo número que en la actualidad. Gestiona y administra también la Sección Deportiva creada en Julio de 2021.